376 papers
Dit onderzoek toont aan dat de co-optatie van een muis-specifiek retrotransposon de transcriptiestartplaats van het Ash2l-gen reguleert, waardoor een muis-specifiek, afgeknot eiwit wordt geproduceerd dat de chromatinestructuur van ontwikkelingsgenen voorbereidt voor embryonale ontwikkeling en motorische neuron-differentiatie.
Deze studie toont aan dat mutaties in de RNA-helicase DDX3X/DED1, die geassocieerd zijn met medulloblastoom, tumorcellen in staat stellen om de groeiremming door TORC1-inhibitie te omzeilen door selectief de vertaling van ongestructureerde, groeibevorderende mRNA's te verhogen terwijl die van gestructureerde transcripten wordt onderdrukt.
Deze paper introduceert het MASS-probleem en bijbehorende algoritmen om RNA-structuren te clusteren en gedeelde structurele motieven tegelijkertijd te identificeren, waardoor een gebalanceerde samenvatting van structurele diversiteit en overeenkomst mogelijk wordt.
Deze studie gebruikt een geïntegreerde structurele dynamiekbenadering om te onthullen hoe de dubbelrolregulator Cti6 en transcriptiefactoren Ash1 en Ume6 de Sin3-complex rekruteren, waardoor de structurele basis voor de wisselwerking tussen genrepressie en -activatie wordt blootgelegd.
Deze studie identificeert via een hoogdoorvoer-methode en deep learning 29 genetische varianten die de regulatoire activiteit in longcellen op allel-specifieke wijze beïnvloeden en zo bijdragen aan het risico op ernstige COVID-19.
Dit artikel introduceert InvDNA, een diep leermethode die end-to-end enkelstrengs DNA-sequenties ontwerpt op basis van atomaire ruggegraatcoördinaten en daarmee de sequence recovery en het succesvol vouwen van ontworpen sequenties aanzienlijk verbetert ten opzichte van bestaande RNA- en DNA-benaderingen.
Dit onderzoek onthult dat basale cellen in de bovenste luchtweg via een MYC-afhankelijk CXCL10-CXCR3-signaalpad fungeren als gespecialiseerde wachters die niet alleen het slijmvlies herstellen na een influenza-infectie, maar ook CD8+ NKT-cellen werven om de immuunrespons te coördineren.
Deze studie past een nieuw stochastisch model toe op single-cell RNA-sequencing-data van de Tabula Muris Senis-project om aan te tonen dat mitochondriale DNA-deleties in spiercellen van muizen worden veroorzaakt door zeldzame mutaties gevolgd door snelle klonale expansie, wat resulteert in een gemiddelde ophopingstijd van ongeveer drie maanden.
Deze studie karakteriseert moleculair de Chikungunya-virusuitbraken in Kenia tussen 2017 en 2020, waarbij wordt vastgesteld dat de Indiase Oceaan-lijn met specifieke mutaties voor circulerende stammen, en dat symptomen zoals spierpijn, hoofdpijn en convulsies helpen bij het klinisch onderscheiden van Chikungunya van andere koortsachtige aandoeningen.
Dit onderzoek toont aan dat een specifieke mutatie in het COL4A5-gen, in tegenstelling tot dezelfde mutatie in COL4A3, geen glomerulaire schade veroorzaakt maar wel pathologische verdikking van Bowmans capsule induceert, wat een bioactieve rol van het collagen IV α5α6-α1α2-stel in dit weefsel onthult.
Dit onderzoek toont aan dat Annexine A2 een cruciale rol speelt bij het handhaven van de functie van longoppervlakteactieve stof tijdens schadelijke ventilatie, waarbij een gebrek aan dit eiwit leidt tot verminderde oppervlaktespanningsverlaging en stijvere longen door een tekort aan POPG.
Deze studie toont aan dat in Drosophila-cellen zonder roX-RNA de dodelijke tekorten aan doseringscompensatie worden gecompenseerd door het snel ontstaan van extra X-chromosomen, wat de levensnoodzakelijke rol van X-chromosoomdosering onderstreept.
Dit onderzoek toont aan dat circadiane immunometabole toestanden de tijdsgebonden respons van macrofagen op SARS-CoV-2-spike-eiwitten bepalen, waarbij mitochondriale en metabole veranderingen in plaats van klassieke immuunactivatie de primaire regulerende mechanismen vormen.
Deze studie toont aan dat blootstelling aan PFAS-verbindingen zoals PFOA en GenX celtype-specifieke toxiciteit veroorzaakt door de p53- en TGF-β-signaalwegen te beïnvloeden, waarbij GenX over het algemeen minder cytotoxisch is dan PFOA en weefsel-specifieke verschillen in inflammatoire en DNA-schade-responsen worden waargenomen.
Deze studie introduceert twee nieuwe platforms, scGOAT-seq en GlycoScope, die menselijke lectines gebruiken om functionele glykaanprofielen te integreren in single-cell en ruimtelijke multi-omics analyses, waardoor het mogelijk wordt om glykaanhermodellering en -interacties in immuuncellen en weefsels zoals follikulair lymfoom op te helderen.
Dit onderzoek toont aan dat het evolutionair geconserveerde GTPase Drg1 de vertaling van mitochondriale eiwitten aan het buitenmembraan faciliteert, waardoor het de mitochondriale integriteit, dynamiek en functie beschermt door cytoplasmatische eiwitsynthese te koppelen aan organelhomeostase.
Deze studie toont aan dat kanker-geassocieerde mutaties in het chromodomein van de tumoronderdrukker TIP60 allosterisch de vorming van zijn trimeer en de acetyl-CoA-binding verstoren, waardoor de enzymatische activiteit en de daaropvolgende DNA-reparatie bij genotoxische stress worden verlamd.
Dit onderzoek onthult dat atriumfibrillatie bij geiten gepaard gaat met een gecoördineerde mitochondriale aanpassing waarbij HSPA9 een centrale regulatorische rol speelt in de dysregulatie van de oxidatieve fosforylering.
Deze studie toont aan dat het histone-achtige eiwit Sfx van het R6K-plasmide, in tegenstelling tot het gastheereiwit H-NS, het conjugaatoverdracht-operon selectief stillegt door samen te werken met de Rho-factor, waarbij fase-scheiding en DNA-topologie zorgen voor een specifieke binding aan het plasmide en de vorming van stabiele nucleoproteïne-filamenten die concurrenten uitsluiten.
Dit onderzoek toont aan dat vivo-morpholino's potentieel hebben als tool voor tijdelijke gen-knockdown in de driedoornige stekelbaars, hoewel variabele toediening de consistentie van de resultaten beperkt en verdere optimalisatie vereist.